港鐵指,由於東鐵線延伸過海工程仍在進行中,紅磡站屯馬線新月台啟用後,新月台將隨著相關項目完成分階段啟用,乘客若需在紅磡站轉乘東鐵線或西鐵線(日後屯馬線),須經由車站大堂前往東鐵線或西鐵線(日後屯馬線)新月台轉線。車站會設置相關鐵路線顏色標示,指引乘客前往各月台。
新轉線安排會沿用至東鐵線過海段通車,屆時紅磡站會全面使用新的兩層月台,乘客會在紅磡站兩層新月台乘搭東鐵線及屯馬線。
港鐵並會在紅磡站屯馬線新月台啟用後,於原來的西鐵線路軌範圍逐步架設5條橫跨月台的行人接駁通道,接通兩側的東鐵線月台,接駁通道同樣將於6月20日開始逐步啟用。